據統計，中國農藥生產企業的平均環保投資占總投資的4.86%，而發達國家農藥企業的環保投入約占總投資的30-40%。這表明農藥企業的環保成本仍有較大上升空間，從而成為支撐農藥價格在2011年繼續上行的主要動力之一。
農藥行業的環保政策日趨嚴峻，對農藥行業的影響主要表現在兩方面：上游原料供應緊張和環保設施投入的增加。
原料供應因素：
為完成節能減排的規劃指標，各地對工業企業進行大規模拉閘限電，化工原料生產受到嚴重影響，直接推高了農藥企業的原料成本。在農藥生產旺季，幾乎所有原料到廠價都同比上漲10-20%，其中硫磺原料價格幾乎上漲1倍。
環保設施的投入因素：
農藥企業用于對污染物排放的治理費用大幅增加。以草甘膦為例，用于處理高濃度廢液和其他污染物的成本費用從2009年的6000-7000元/噸上升到10000元/噸以上。
